Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC107Q8WV48 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC107Q8WV48 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC107Q8WV48 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms