Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDZ2

SIMC1, SUMO-interacting motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1Q8NDZ2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SIMC1Q8NDZ2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SIMC1Q8NDZ2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIMC1Q8NDZ2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SIMC1Q8NDZ2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SIMC1Q8NDZ2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIMC1Q8NDZ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIMC1Q8NDZ2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIMC1Q8NDZ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIMC1Q8NDZ2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SIMC1Q8NDZ2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIMC1Q8NDZ2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SIMC1Q8NDZ2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms