Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC63Q8NA47 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC63Q8NA47 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC63Q8NA47 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms