Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SVBPQ8N300 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SVBPQ8N300 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.3 ms