Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCUBE3Q8IX30 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCUBE3Q8IX30 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms