Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMEM139Q8IV31 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMEM139Q8IV31 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM139Q8IV31 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms