Protein–RNA interactions for Protein: Q86SI9

C5orf38, Protein CEI, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf38Q86SI9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C5orf38Q86SI9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C5orf38Q86SI9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.4 ms