Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC11Q7Z392 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC11Q7Z392 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRAPPC11Q7Z392 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms