Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00173Q6ZV60 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LINC00173Q6ZV60 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms