Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
WDR88Q6ZMY6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
WDR88Q6ZMY6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WDR88Q6ZMY6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms