Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFCAB12Q6NXP0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFCAB12Q6NXP0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EFCAB12Q6NXP0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms