Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WSCD1Q658N2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
WSCD1Q658N2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WSCD1Q658N2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms