Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SPANXN1Q5VSR9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SPANXN1Q5VSR9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.7 ms