Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
CCDC181Q5TID7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC181Q5TID7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC181Q5TID7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms