Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COLEC12Q5KU26 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COLEC12Q5KU26 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COLEC12Q5KU26 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COLEC12Q5KU26 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms