Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SWI5Q1ZZU3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SWI5Q1ZZU3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SWI5Q1ZZU3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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