Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ME3Q16798 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ME3Q16798 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ME3Q16798 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ME3Q16798 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ME3Q16798 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ME3Q16798 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ME3Q16798 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ME3Q16798 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ME3Q16798 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ME3Q16798 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ME3Q16798 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ME3Q16798 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ME3Q16798 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ME3Q16798 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ME3Q16798 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ME3Q16798 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ME3Q16798 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ME3Q16798 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ME3Q16798 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ME3Q16798 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ME3Q16798 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ME3Q16798 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ME3Q16798 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ME3Q16798 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ME3Q16798 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ME3Q16798 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ME3Q16798 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ME3Q16798 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ME3Q16798 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ME3Q16798 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ME3Q16798 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ME3Q16798 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ME3Q16798 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ME3Q16798 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ME3Q16798 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ME3Q16798 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ME3Q16798 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ME3Q16798 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ME3Q16798 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ME3Q16798 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ME3Q16798 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ME3Q16798 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ME3Q16798 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ME3Q16798 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ME3Q16798 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ME3Q16798 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ME3Q16798 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ME3Q16798 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ME3Q16798 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ME3Q16798 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ME3Q16798 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ME3Q16798 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ME3Q16798 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ME3Q16798 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ME3Q16798 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ME3Q16798 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ME3Q16798 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ME3Q16798 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ME3Q16798 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ME3Q16798 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ME3Q16798 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ME3Q16798 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ME3Q16798 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ME3Q16798 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ME3Q16798 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ME3Q16798 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ME3Q16798 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ME3Q16798 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ME3Q16798 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ME3Q16798 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ME3Q16798 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ME3Q16798 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ME3Q16798 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ME3Q16798 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ME3Q16798 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ME3Q16798 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ME3Q16798 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ME3Q16798 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ME3Q16798 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ME3Q16798 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ME3Q16798 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ME3Q16798 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ME3Q16798 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ME3Q16798 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ME3Q16798 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ME3Q16798 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ME3Q16798 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ME3Q16798 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ME3Q16798 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ME3Q16798 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ME3Q16798 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ME3Q16798 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ME3Q16798 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ME3Q16798 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ME3Q16798 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ME3Q16798 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ME3Q16798 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ME3Q16798 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ME3Q16798 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
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