Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDKN3Q16667 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDKN3Q16667 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDKN3Q16667 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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