Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PSME4Q14997 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PSME4Q14997 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PSME4Q14997 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSME4Q14997 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
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