Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSHL1Q14406 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSHL1Q14406 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSHL1Q14406 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187 ms