Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PDE6HQ13956 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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PDE6HQ13956 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PDE6HQ13956 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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PDE6HQ13956 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PDE6HQ13956 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PDE6HQ13956 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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PDE6HQ13956 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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PDE6HQ13956 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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PDE6HQ13956 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDE6HQ13956 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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