Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CALCOCO2Q13137 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CALCOCO2Q13137 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CALCOCO2Q13137 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
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