Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
MKRN3Q13064 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MKRN3Q13064 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
MKRN3Q13064 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MKRN3Q13064 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
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