Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTP4A2Q12974 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTP4A2Q12974 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTP4A2Q12974 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
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