Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
POLEQ07864 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLEQ07864 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLEQ07864 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLEQ07864 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLEQ07864 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
POLEQ07864 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLEQ07864 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLEQ07864 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLEQ07864 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLEQ07864 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLEQ07864 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLEQ07864 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLEQ07864 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLEQ07864 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
POLEQ07864 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLEQ07864 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLEQ07864 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLEQ07864 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLEQ07864 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
POLEQ07864 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLEQ07864 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLEQ07864 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLEQ07864 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLEQ07864 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLEQ07864 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLEQ07864 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
POLEQ07864 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
POLEQ07864 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
POLEQ07864 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLEQ07864 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLEQ07864 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLEQ07864 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLEQ07864 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLEQ07864 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
POLEQ07864 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLEQ07864 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLEQ07864 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLEQ07864 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLEQ07864 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLEQ07864 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLEQ07864 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLEQ07864 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLEQ07864 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLEQ07864 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLEQ07864 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLEQ07864 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLEQ07864 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLEQ07864 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLEQ07864 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLEQ07864 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLEQ07864 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLEQ07864 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLEQ07864 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLEQ07864 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLEQ07864 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLEQ07864 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLEQ07864 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLEQ07864 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLEQ07864 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLEQ07864 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLEQ07864 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLEQ07864 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLEQ07864 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLEQ07864 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLEQ07864 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLEQ07864 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLEQ07864 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLEQ07864 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLEQ07864 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLEQ07864 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLEQ07864 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLEQ07864 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLEQ07864 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLEQ07864 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLEQ07864 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLEQ07864 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLEQ07864 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLEQ07864 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLEQ07864 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLEQ07864 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLEQ07864 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLEQ07864 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLEQ07864 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLEQ07864 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLEQ07864 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLEQ07864 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLEQ07864 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLEQ07864 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLEQ07864 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLEQ07864 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLEQ07864 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLEQ07864 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLEQ07864 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLEQ07864 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLEQ07864 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLEQ07864 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLEQ07864 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLEQ07864 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLEQ07864 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms