Protein–RNA interactions for Protein: Q06830

PRDX1, Peroxiredoxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX1Q06830 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PRDX1Q06830 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDX1Q06830 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms