Protein–RNA interactions for Protein: Q05066

SRY, Sex-determining region Y protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRYQ05066 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRYQ05066 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRYQ05066 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRYQ05066 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SRYQ05066 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRYQ05066 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRYQ05066 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRYQ05066 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SRYQ05066 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SRYQ05066 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRYQ05066 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRYQ05066 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRYQ05066 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SRYQ05066 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SRYQ05066 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRYQ05066 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRYQ05066 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRYQ05066 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRYQ05066 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SRYQ05066 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRYQ05066 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRYQ05066 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRYQ05066 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SRYQ05066 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRYQ05066 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRYQ05066 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRYQ05066 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRYQ05066 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRYQ05066 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRYQ05066 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SRYQ05066 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRYQ05066 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRYQ05066 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRYQ05066 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRYQ05066 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRYQ05066 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRYQ05066 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRYQ05066 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SRYQ05066 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRYQ05066 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRYQ05066 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRYQ05066 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRYQ05066 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRYQ05066 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRYQ05066 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRYQ05066 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRYQ05066 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRYQ05066 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SRYQ05066 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRYQ05066 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRYQ05066 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRYQ05066 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRYQ05066 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRYQ05066 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRYQ05066 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRYQ05066 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRYQ05066 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRYQ05066 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRYQ05066 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRYQ05066 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRYQ05066 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRYQ05066 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRYQ05066 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRYQ05066 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRYQ05066 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRYQ05066 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRYQ05066 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRYQ05066 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRYQ05066 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRYQ05066 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRYQ05066 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRYQ05066 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRYQ05066 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SRYQ05066 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SRYQ05066 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRYQ05066 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SRYQ05066 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRYQ05066 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRYQ05066 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRYQ05066 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRYQ05066 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRYQ05066 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRYQ05066 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRYQ05066 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SRYQ05066 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRYQ05066 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SRYQ05066 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRYQ05066 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRYQ05066 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRYQ05066 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRYQ05066 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRYQ05066 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRYQ05066 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRYQ05066 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRYQ05066 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRYQ05066 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRYQ05066 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRYQ05066 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRYQ05066 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRYQ05066 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms