Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX2Q02962 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX2Q02962 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX2Q02962 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms