Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD83Q01151 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD83Q01151 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD83Q01151 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD83Q01151 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD83Q01151 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CD83Q01151 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CD83Q01151 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD83Q01151 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD83Q01151 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD83Q01151 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD83Q01151 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD83Q01151 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD83Q01151 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD83Q01151 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD83Q01151 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CD83Q01151 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD83Q01151 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD83Q01151 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD83Q01151 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CD83Q01151 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CD83Q01151 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD83Q01151 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD83Q01151 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD83Q01151 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD83Q01151 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD83Q01151 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD83Q01151 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD83Q01151 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD83Q01151 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD83Q01151 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD83Q01151 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CD83Q01151 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD83Q01151 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD83Q01151 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD83Q01151 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD83Q01151 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD83Q01151 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CD83Q01151 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD83Q01151 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD83Q01151 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD83Q01151 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD83Q01151 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CD83Q01151 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD83Q01151 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CD83Q01151 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CD83Q01151 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD83Q01151 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD83Q01151 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD83Q01151 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD83Q01151 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD83Q01151 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD83Q01151 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD83Q01151 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD83Q01151 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD83Q01151 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD83Q01151 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD83Q01151 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD83Q01151 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD83Q01151 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD83Q01151 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CD83Q01151 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD83Q01151 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CD83Q01151 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD83Q01151 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD83Q01151 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD83Q01151 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD83Q01151 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD83Q01151 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD83Q01151 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD83Q01151 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD83Q01151 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD83Q01151 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD83Q01151 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD83Q01151 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CD83Q01151 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD83Q01151 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD83Q01151 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD83Q01151 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD83Q01151 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CD83Q01151 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms