Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E2F1Q01094 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
E2F1Q01094 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
E2F1Q01094 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms