Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CLTCQ00610 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CLTCQ00610 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CLTCQ00610 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CLTCQ00610 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLTCQ00610 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms