Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TFAMQ00059 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TFAMQ00059 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TFAMQ00059 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms