Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM3AP98173 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAM3AP98173 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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