Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCNA1P78396 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCNA1P78396 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCNA1P78396 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms