Protein–RNA interactions for Protein: P61289

PSME3, Proteasome activator complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3P61289 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSME3P61289 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME3P61289 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME3P61289 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME3P61289 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME3P61289 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME3P61289 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSME3P61289 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME3P61289 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME3P61289 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME3P61289 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME3P61289 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME3P61289 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME3P61289 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME3P61289 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME3P61289 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSME3P61289 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME3P61289 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME3P61289 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME3P61289 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME3P61289 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSME3P61289 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME3P61289 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME3P61289 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME3P61289 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME3P61289 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME3P61289 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME3P61289 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME3P61289 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME3P61289 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME3P61289 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME3P61289 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME3P61289 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSME3P61289 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME3P61289 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME3P61289 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME3P61289 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME3P61289 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME3P61289 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME3P61289 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME3P61289 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSME3P61289 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSME3P61289 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PSME3P61289 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME3P61289 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME3P61289 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME3P61289 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME3P61289 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME3P61289 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSME3P61289 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME3P61289 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME3P61289 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME3P61289 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME3P61289 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME3P61289 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME3P61289 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME3P61289 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME3P61289 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSME3P61289 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME3P61289 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME3P61289 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME3P61289 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME3P61289 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSME3P61289 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME3P61289 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME3P61289 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME3P61289 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME3P61289 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME3P61289 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME3P61289 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSME3P61289 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME3P61289 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME3P61289 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME3P61289 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME3P61289 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME3P61289 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME3P61289 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME3P61289 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME3P61289 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME3P61289 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME3P61289 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME3P61289 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSME3P61289 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME3P61289 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME3P61289 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME3P61289 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME3P61289 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME3P61289 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSME3P61289 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSME3P61289 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSME3P61289 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME3P61289 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME3P61289 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME3P61289 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSME3P61289 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME3P61289 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME3P61289 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME3P61289 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME3P61289 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSME3P61289 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms