Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D3P61077 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D3P61077 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D3P61077 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D3P61077 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D3P61077 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D3P61077 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBE2D3P61077 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
UBE2D3P61077 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
UBE2D3P61077 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms