Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRP54P61011 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP54P61011 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP54P61011 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP54P61011 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP54P61011 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP54P61011 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP54P61011 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP54P61011 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP54P61011 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP54P61011 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP54P61011 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRP54P61011 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP54P61011 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP54P61011 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP54P61011 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP54P61011 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP54P61011 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP54P61011 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP54P61011 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP54P61011 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRP54P61011 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP54P61011 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP54P61011 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP54P61011 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP54P61011 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP54P61011 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP54P61011 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP54P61011 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP54P61011 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP54P61011 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP54P61011 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP54P61011 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRP54P61011 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP54P61011 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP54P61011 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP54P61011 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP54P61011 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP54P61011 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP54P61011 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP54P61011 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP54P61011 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRP54P61011 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP54P61011 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP54P61011 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP54P61011 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP54P61011 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP54P61011 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP54P61011 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP54P61011 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRP54P61011 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP54P61011 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP54P61011 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP54P61011 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP54P61011 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP54P61011 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP54P61011 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP54P61011 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP54P61011 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SRP54P61011 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP54P61011 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP54P61011 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP54P61011 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP54P61011 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRP54P61011 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP54P61011 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP54P61011 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP54P61011 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP54P61011 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP54P61011 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP54P61011 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP54P61011 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP54P61011 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP54P61011 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP54P61011 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRP54P61011 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP54P61011 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP54P61011 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRP54P61011 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRP54P61011 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRP54P61011 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRP54P61011 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRP54P61011 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRP54P61011 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRP54P61011 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SRP54P61011 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRP54P61011 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP54P61011 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP54P61011 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP54P61011 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP54P61011 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP54P61011 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP54P61011 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP54P61011 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP54P61011 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP54P61011 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP54P61011 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP54P61011 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP54P61011 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRP54P61011 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 439.3 ms