Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATN1P54259 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATN1P54259 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATN1P54259 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATN1P54259 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATN1P54259 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATN1P54259 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATN1P54259 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATN1P54259 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATN1P54259 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATN1P54259 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATN1P54259 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATN1P54259 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATN1P54259 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATN1P54259 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATN1P54259 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATN1P54259 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATN1P54259 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATN1P54259 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATN1P54259 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ATN1P54259 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATN1P54259 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATN1P54259 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATN1P54259 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATN1P54259 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATN1P54259 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATN1P54259 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATN1P54259 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATN1P54259 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATN1P54259 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATN1P54259 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATN1P54259 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATN1P54259 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATN1P54259 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATN1P54259 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATN1P54259 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATN1P54259 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATN1P54259 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATN1P54259 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATN1P54259 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATN1P54259 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATN1P54259 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATN1P54259 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATN1P54259 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATN1P54259 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATN1P54259 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATN1P54259 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATN1P54259 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATN1P54259 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATN1P54259 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATN1P54259 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATN1P54259 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATN1P54259 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATN1P54259 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATN1P54259 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATN1P54259 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATN1P54259 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ATN1P54259 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATN1P54259 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATN1P54259 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATN1P54259 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATN1P54259 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATN1P54259 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATN1P54259 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATN1P54259 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATN1P54259 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATN1P54259 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATN1P54259 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATN1P54259 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATN1P54259 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATN1P54259 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATN1P54259 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATN1P54259 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATN1P54259 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATN1P54259 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATN1P54259 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATN1P54259 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATN1P54259 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATN1P54259 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATN1P54259 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATN1P54259 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATN1P54259 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATN1P54259 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATN1P54259 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATN1P54259 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATN1P54259 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATN1P54259 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATN1P54259 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATN1P54259 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATN1P54259 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATN1P54259 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATN1P54259 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATN1P54259 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATN1P54259 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATN1P54259 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATN1P54259 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATN1P54259 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATN1P54259 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATN1P54259 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATN1P54259 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms