Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC18A1P54219 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC18A1P54219 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18A1P54219 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms