Protein–RNA interactions for Protein: P51795

CLCN5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN5P51795 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLCN5P51795 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLCN5P51795 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLCN5P51795 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms