Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA1P49639 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXA1P49639 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA1P49639 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA1P49639 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA1P49639 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA1P49639 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA1P49639 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA1P49639 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA1P49639 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA1P49639 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA1P49639 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA1P49639 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA1P49639 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA1P49639 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA1P49639 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA1P49639 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA1P49639 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms