Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN7P41732 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN7P41732 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN7P41732 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms