Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP2P32456 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP2P32456 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP2P32456 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP2P32456 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP2P32456 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP2P32456 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GBP2P32456 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP2P32456 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP2P32456 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP2P32456 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP2P32456 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP2P32456 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP2P32456 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP2P32456 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP2P32456 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GBP2P32456 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP2P32456 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP2P32456 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP2P32456 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP2P32456 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP2P32456 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GBP2P32456 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP2P32456 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP2P32456 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP2P32456 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP2P32456 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP2P32456 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP2P32456 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP2P32456 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP2P32456 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GBP2P32456 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP2P32456 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP2P32456 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP2P32456 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP2P32456 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP2P32456 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP2P32456 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP2P32456 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GBP2P32456 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP2P32456 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP2P32456 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP2P32456 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP2P32456 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GBP2P32456 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP2P32456 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP2P32456 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP2P32456 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP2P32456 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP2P32456 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP2P32456 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP2P32456 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP2P32456 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP2P32456 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP2P32456 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GBP2P32456 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP2P32456 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP2P32456 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP2P32456 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP2P32456 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP2P32456 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP2P32456 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GBP2P32456 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP2P32456 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP2P32456 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP2P32456 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP2P32456 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GBP2P32456 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP2P32456 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP2P32456 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP2P32456 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP2P32456 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP2P32456 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP2P32456 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP2P32456 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP2P32456 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GBP2P32456 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP2P32456 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GBP2P32456 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP2P32456 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GBP2P32456 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GBP2P32456 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GBP2P32456 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP2P32456 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP2P32456 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP2P32456 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP2P32456 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP2P32456 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP2P32456 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GBP2P32456 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP2P32456 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP2P32456 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP2P32456 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP2P32456 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP2P32456 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP2P32456 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP2P32456 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP2P32456 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GBP2P32456 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GBP2P32456 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms