Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GTF2E1P29083 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GTF2E1P29083 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF2E1P29083 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GTF2E1P29083 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms