Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRR1P24046 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRR1P24046 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRR1P24046 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRR1P24046 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRR1P24046 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRR1P24046 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABRR1P24046 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABRR1P24046 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRR1P24046 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRR1P24046 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms