Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM27P14373 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRIM27P14373 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRIM27P14373 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms