Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RARGP13631 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARGP13631 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RARGP13631 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARGP13631 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARGP13631 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARGP13631 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARGP13631 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RARGP13631 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARGP13631 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RARGP13631 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RARGP13631 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARGP13631 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARGP13631 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARGP13631 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARGP13631 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARGP13631 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARGP13631 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RARGP13631 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARGP13631 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARGP13631 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RARGP13631 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARGP13631 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARGP13631 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RARGP13631 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RARGP13631 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RARGP13631 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARGP13631 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RARGP13631 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARGP13631 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARGP13631 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARGP13631 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARGP13631 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RARGP13631 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARGP13631 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARGP13631 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARGP13631 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARGP13631 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RARGP13631 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RARGP13631 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RARGP13631 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARGP13631 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARGP13631 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARGP13631 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARGP13631 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARGP13631 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RARGP13631 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARGP13631 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARGP13631 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARGP13631 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARGP13631 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RARGP13631 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARGP13631 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARGP13631 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARGP13631 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARGP13631 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARGP13631 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARGP13631 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARGP13631 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARGP13631 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARGP13631 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARGP13631 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARGP13631 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RARGP13631 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARGP13631 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARGP13631 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARGP13631 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RARGP13631 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARGP13631 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARGP13631 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARGP13631 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARGP13631 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RARGP13631 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARGP13631 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARGP13631 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARGP13631 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARGP13631 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARGP13631 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARGP13631 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARGP13631 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RARGP13631 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARGP13631 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARGP13631 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARGP13631 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARGP13631 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARGP13631 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARGP13631 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARGP13631 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RARGP13631 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARGP13631 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARGP13631 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARGP13631 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARGP13631 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RARGP13631 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARGP13631 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARGP13631 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARGP13631 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARGP13631 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARGP13631 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RARGP13631 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms