Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RLBP1P12271 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RLBP1P12271 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms