Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNB1P11230 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNB1P11230 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNB1P11230 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms