Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GLI4P10075 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GLI4P10075 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GLI4P10075 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GLI4P10075 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GLI4P10075 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GLI4P10075 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GLI4P10075 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GLI4P10075 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GLI4P10075 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GLI4P10075 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GLI4P10075 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GLI4P10075 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GLI4P10075 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GLI4P10075 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GLI4P10075 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GLI4P10075 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GLI4P10075 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GLI4P10075 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GLI4P10075 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GLI4P10075 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GLI4P10075 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GLI4P10075 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GLI4P10075 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GLI4P10075 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GLI4P10075 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GLI4P10075 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GLI4P10075 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GLI4P10075 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GLI4P10075 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GLI4P10075 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GLI4P10075 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GLI4P10075 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GLI4P10075 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GLI4P10075 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GLI4P10075 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GLI4P10075 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GLI4P10075 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GLI4P10075 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI4P10075 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI4P10075 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI4P10075 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI4P10075 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI4P10075 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI4P10075 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI4P10075 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI4P10075 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI4P10075 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GLI4P10075 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI4P10075 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI4P10075 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI4P10075 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI4P10075 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI4P10075 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI4P10075 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI4P10075 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI4P10075 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI4P10075 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI4P10075 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI4P10075 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GLI4P10075 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI4P10075 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI4P10075 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI4P10075 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI4P10075 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI4P10075 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GLI4P10075 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI4P10075 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI4P10075 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI4P10075 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI4P10075 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI4P10075 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI4P10075 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI4P10075 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI4P10075 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GLI4P10075 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI4P10075 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI4P10075 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI4P10075 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI4P10075 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GLI4P10075 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GLI4P10075 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI4P10075 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI4P10075 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI4P10075 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI4P10075 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI4P10075 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI4P10075 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI4P10075 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI4P10075 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI4P10075 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GLI4P10075 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI4P10075 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI4P10075 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI4P10075 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI4P10075 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI4P10075 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI4P10075 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI4P10075 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GLI4P10075 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms